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肿瘤早筛

  肿瘤早筛

肿瘤早筛案例展示

案例分析一

循环肿瘤DNA甲基化标志物在肝癌诊断和预后中的应用

Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma. Nat Mater. 2017;16(11):1155-1161.(IF= 39.235)

一、研究背景

监测治疗和早期发现恶性乳腺癌(BC)仍然是临床上急需解决的问题。异常循环DNA甲基化模式可能提供一个高度特异的癌症信号,因此,cfDNA甲基化标记物可以指示乳腺癌的播散。

二、研究方法

1、取材:血浆样本

HCCn=1098

正常对照:n=835

2、测序:

3、验证:高通量BSP

4、功能:

三、研究结果

1) 通过比较HCC组织和正常血白细胞,确定了一个HCC特异性甲基化标志物Panel;

2) HCC肿瘤DNA和匹配的血浆cfDNA的甲基化谱高度相关;

3) 利用1098HCC患者和835例正常对照者的cfDNA样本,构建了一个高特异性和敏感性的诊断预测模型(p<0.001), 并与肿瘤负担、治疗反应和分期高度相关;

4) 建立了一个预测预后和生存率的预测模型(p<0.001).

四、研究结论

结果表明在一个大型临床队列中,ctDNA甲基化标记物在肝癌的诊断、监测和预后中的作用。

 


             

图1. 数据生成与分析工作流程图                                                                            图2. 肝癌诊断与cfDNA甲基化

 

 

   

图3. cfDNA甲基化与肿瘤负荷、治疗反应和分期                                              图4. cfDNA甲基化分析预测HCC生存率

 

 

案例分析二

血清甲基化用于乳腺癌转移早期筛查

Methylation patterns in serum DNA for early identification of disseminated breast cancer. Genome Med. 2017;22;9(1):115.(IF= 8.898)

一、研究背景

监测治疗和早期发现转移乳腺癌(BC)仍然是临床上急需解决的问题。异常循环DNA甲基化模式可能提供一个高度特异的癌症信号,因此,cfDNA甲基化标记物可以指示乳腺癌的转移。

二、研究方法

1、取材:组织和血清

组织:n=31(筛选甲基化标志物)

血清:n=110(模型), n=1344(验证)

2、测序:简化基因组甲基化测序(RRBS)          

高通量BSP

3、验证:高通量BSP

4、功能:

三、研究结果

1) BC组织中共发现18BC特异性甲基化标志物,其中6个在血清中得到进一步验证;

2) 候选EFC#93经验证可用于临床,是化疗前独立的不良预后标志物(死亡风险比HR7.689), 优于循环肿瘤细胞(CTC)(死亡风险比=5.681);

3) 在化疗前70%以上的CTCEFC#93血清阳性患者在5年内复发;

4) 化疗后EFC#93阳性转移患者对抗激素治疗有反应;

5) 血清EFC#93阳性受检者中分别有42.9%25%在测试后3-6个月和6-12个月内被诊断为转移性BC, 检测特异性为88%.

四、研究结论

血清EFC#93甲基化为早期诊断和治疗转移性乳腺癌提供了一个新的工具。

 

             


          图1. 研究技术方案                                                                                                    图2. 组织中甲基化筛选的流程

 

                   


图3. SUCCESS试验样本中EFC#93血清甲基化与CTC分析                                                         图4. UKCTOCS试验女性样本中EFC#93甲基化分析


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